Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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UBL4AP11441 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL4AP11441 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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