Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GLI3P10071 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GLI3P10071 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GLI3P10071 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GLI3P10071 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GLI3P10071 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GLI3P10071 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GLI3P10071 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLI3P10071 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLI3P10071 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLI3P10071 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLI3P10071 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLI3P10071 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLI3P10071 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GLI3P10071 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms