Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CT47B1P0C2W7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms