Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRT6BP04259 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT6BP04259 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms