Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF13O43567 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF13O43567 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF13O43567 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF13O43567 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF13O43567 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF13O43567 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF13O43567 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF13O43567 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF13O43567 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF13O43567 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF13O43567 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF13O43567 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF13O43567 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF13O43567 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms