Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD1AO15047 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms