Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms