Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E9PBE3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E9PBE3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms