Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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