Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms