Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms