Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms