Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms