Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms