Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TBCCD1Q9NVR7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms