Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms