Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPHS2Q9NP85 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms