Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRPM3Q9HCF6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPM3Q9HCF6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms