Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM55Q9BYV6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms