Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms