Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PLVAPQ9BX97 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms