Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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