Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms