Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT17Q9BSW7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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