Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms