Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5RAP3Q96JB5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms