Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms