Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCE1Q969G3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms