Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATA6Q92908 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms