Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMNTD2Q8IXW0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms