Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYT9Q86SS6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms