Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC46A3Q7Z3Q1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC46A3Q7Z3Q1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms