Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CATSPER4Q7RTX7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms