Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms