Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFPL4BQ6ZWI9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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