Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXK5

LRRN1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1Q6UXK5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRN1Q6UXK5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRN1Q6UXK5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRN1Q6UXK5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRN1Q6UXK5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRN1Q6UXK5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRN1Q6UXK5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRN1Q6UXK5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRN1Q6UXK5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRN1Q6UXK5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRRN1Q6UXK5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRN1Q6UXK5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRN1Q6UXK5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRN1Q6UXK5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRN1Q6UXK5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms