Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms