Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C3orf33Q6P1S2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms