Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms