Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms