Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC36A3Q495N2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms