Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPPQ16740 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms