Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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