Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms