Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms