Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC3Q15034 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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