Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC10A1Q14973 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms