Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
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