Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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NCOA4Q13772 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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NCOA4Q13772 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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NCOA4Q13772 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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NCOA4Q13772 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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NCOA4Q13772 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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NCOA4Q13772 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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NCOA4Q13772 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCOA4Q13772 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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