Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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PEX6Q13608 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PEX6Q13608 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PEX6Q13608 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PEX6Q13608 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PEX6Q13608 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PEX6Q13608 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PEX6Q13608 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
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